Marker aşılar, aşılı ve enfekte hayvanlar arasında ki serolojik ayrımı sağlar.
Aşılı ve enfekte hayvanların ayrımı, saha suşu mikroorganizmalarda bulunan bir veya daha fazla proteinin aşıda bulunmamasına bağlıdır. Aşı suşunda bulunmayan proteine karşı antikor belirleyen testler antikor belirleyen testlerin kullanımı, aşılı populasyonlarda enfekte bireylerin belirlenmesini sağlar. Böylece aşılı bir sürüdeki enfeksiyon tespit edilebilir.
